Obdržet oznámení o zahájení daňové kontroly patří k nejnepříjemnějším situacím, se kterými se může podnikatel nebo firma setkat. Nejde o pouhou administrativní formalitu – od tohoto okamžiku začíná proces, který může vést k doměření daně, penále i sankcím. Kroky, které jsou následně učiněny v daňové kontrole často rozhodují nejen o výsledku celé kontroly, ale i o šancích na úspěch v odvolacím řízení či před soudem.

1. Oznámení o zahájení daňové kontroly

Daňová kontrola je zákonem upravený postup, jehož cílem je ověřit, zda daňový subjekt splnil své daňové povinnosti v souladu s právními předpisy. Daňová kontrola se zahajuje dnem doručení oznámení o zahájení kontroly daňovému subjektu. Oznámení obsahuje vymezení předmětu – tedy jaké daně a zdaňovací období budou předmětem prověřování, a rozsahu kontroly – teda, zda bude určitá daň kontrolována v plném rozsahu, nebo budou prověřovány jen vybrané transakce. Rozsah daňové kontroly může být v průběhu kontroly pozměněn oznámením o jeho změně.

2. Povinnosti daňového subjektu

Daňový subjekt má během kontroly povinnost umožnit provedení daňové kontroly. To zahrnuje zejména:

• předložení účetních dokladů, evidencí a související dokumentace,
• zajištění přístupu do provozoven a k relevantním systémům,
• předložení důkazů k údajům uvedeným v daňových přiznáních,
• umožnění jednání s odpovědnými zaměstnanci a dalšími osobami,
• povinnost nezatajovat důkazy, které má k dispozici nebo ví, kde se nacházejí.
  
  

3. Důkazní břemeno daňového subjektu

Důkazní břemeno v daňové kontrole znamená povinnost daňového subjektu prokázat správnost skutečností, které uvádí v daňovém přiznání. Jakmile správce daně prokazatelně zpochybní důkazy předložené daňovým subjektem, je pak na daňovém subjektu, aby tyto skutečnosti doložil dalšími konkrétními a přesvědčivými důkazy.

Pokud se to nepodaří, má to přímé důsledky – typicky např. neuznání uplatněných nákladů jako daňově uznatelných, úpravu základu daně a doměření daně, často včetně penále a úroků z prodlení.

Důkazní břemeno se přitom netýká pouze předložení formálních dokladů, ale také prokázání skutečného ekonomického smyslu transakcí a jejich vazby na zdanitelné příjmy.

Současně platí, že důkazní břemeno není vždy výlučně na daňovém subjektu. Existují výjimky, kdy je povinnost prokázat určité skutečnosti primárně na správci daně.