
Daňové kontroly patří mezi klíčové nástroje správy daní v České republice. Finanční správa (FS) prostřednictvím těchto kontrol ověřuje správnost vykazování daňových povinností daňových subjektů a zajišťuje, aby výše stanovené daně odpovídala skutečně dosaženým příjmům a uskutečněným transakcím. V posledních letech se statistiky daňových kontrol mění i s ohledem na přístup FS k rizikovějším oblastem a cílenější zaměření kontrolní činnosti.
Podle souhrnných statistik FS bylo v posledních letech ukončeno přibližně 9 až 11 tisíc daňových kontrol ročně. Konkrétní údaje za roky 2022–2024 shrnuje následující tabulka, která zároveň ukazuje objem doměřené daně a výši snížení daňových ztrát.
Rok | Počet ukončených | Doměřeno z kontrol | Snížení daňových ztrát |
2022 | 9 658 | 6 707 mil. Kč | 1 558 mil. Kč |
2023 | 10 656 | 10 779 mil. Kč | 1 973 mil. Kč |
2024 | 9 757 | 5 978 mil. Kč | 2 975 mil. Kč |
Zdroj: zpracováno na základě výročních zpráv FS
Z údajů je patrné, že počet ukončených kontrol v roce 2024 oproti roku 2023 mírně poklesl, zatímco výše snížení daňových ztrát dosáhla nejvyšší hodnoty sledovaného období.
V roce 2022 bylo ukončeno 9 658 kontrol, což vedlo k doměrkům ve výši cca 6,7 miliardy Kč a snížení daňových ztrát o cca 1,6 miliardy Kč. Rok 2023 zaznamenal nárůst počtu kontrol na 10 656 a zároveň výrazné zvýšení doměrek na cca 10,8 miliardy Kč, což naznačuje, že kontrolní činnost byla intenzivnější a zaměřena na oblasti s vyšším daňovým dopadem. V roce 2024 došlo k poklesu počtu kontrol na 9 757, avšak snížení daňových ztrát vzrostlo na téměř 3 miliardy Kč, což svědčí o cílenější strategii FS: méně kontrol, ale s vyšším fiskálním efektem a také zaměření na poplatníky, kteří vykazují daňové ztráty.
Největší podíl na tom mají kontroly DPH, kde se zaměřování FS soustřeďuje na odhalování řetězových podvodů, neoprávněné nároky na odpočet, nepřiznání uskutečněných zdanitelných plnění a nesprávně vykázané intrakomunitární transakce.
Tento trend ukazuje, že daňové kontroly se stále více zaměřují na rizikové oblasti s potenciálně vyššími chybami a daňovými úniky.
Rok | Počet ukončených POP | Ukončené POP se změnou daňové povinnosti |
2022 | 9 753 | 6 387 |
2023 | 8 812 | 5 723 |
2024 | 6 937 | 4 114 |
Zdroj: vlastní tvorba na základě výročních zpráv FS
Vedle klasických daňových kontrol FS rovněž provádí tzv. postupy k odstranění pochybností, které doplňují kontrolní činnost. V roce 2024 bylo ukončeno přes 6 900 takových postupů, z nichž přibližně 60 % vedlo ke změně daňových povinností – ať už ke zvýšení nebo ke snížení podle výsledků přezkumu tvrzení daňového subjektu.
Tyto postupy jsou významné zejména proto, že často umožňují správci daně vyjasnit nejasnosti bez formální daňové kontroly, což bývá rychlejší a méně zatěžující varianta prověřování. Postup k odstranění pochybností byl nejčastěji uplatňován u daně z přidané hodnoty (DPH) a daně z příjmů fyzických osob.
Úspěšnost odvolání představuje důležitý indikátor vývoje daňového řízení z pohledu daňových subjektů. Ačkoliv se počty podaných odvolání příliš nemění, počet úspěšných odvolání, zejména na úrovni Odvolacího finančního ředitelství, v průběhu let postupně klesá. Tento pokles se promítá i v částce, ve které Odvolací finanční ředitelství daňovým subjektům vyhovělo, kdy se v roce 2022 jednalo o částku přibližně 4,4 miliardy Kč, v roce 2023 to bylo už jen 2,8 miliardy Kč a v roce 2024 dokonce už jen 1,8 miliardy Kč.
Rok | Počet dříve podaných odvolání – nevyřízených k 1.1. | Počet nově podaných odvolání | Vyhověno na úrovni finančního úřadu | Vyhověno u OFŘ ve sporné částce | Vyhověno u OFŘ ve prospěch rozdílně od sporné částky | Vyhověno celkem |
2022 | 4 456 | 4 991 | 1 028 | 1 095 | 835 | 2 958 |
2023 | 4 269 | 4 994 | 988 | 1 105 | 644 | 2 737 |
2024 | 4 239 | 4 744 | 1 058 | 605 | 573 | 2 236 |
Zdroj: vytvořeno na základě výročních zpráv FS
Nejvyšší počet odvolání byl ve všech sledovaných letech zaznamenán u daně z přidané hodnoty, přičemž jejich počet násobně převýšil druhou nejpočetnější daň, kterou je daň z příjmů právnických osob.
Vývoj daňových kontrol v posledních letech ukazuje, že ačkoli se celkový počet kontrol a postupů k odstranění pochybností mírně snižuje, Finanční správa aktivně klade důraz na cílené kontroly zejména v oblastech s vyšším rizikem nesprávného stanovení daně, jako je DPH. Statistiky rovněž naznačují, že metodika a praxe kontrol, odvolání i využití postupů k odstranění pochybností se postupně přizpůsobují měnícímu se daňovému prostředí.
Z pohledu daňových subjektů je důležité i to, že ačkoli počet podaných odvolání zůstává v čase relativně podobný, prostor pro úspěch v odvolacím řízení se podle dat spíše zužuje, zejména na úrovni Odvolacího finančního ředitelství. O to větší význam má prevence a správná procesní strategie už v průběhu prověřování – od první komunikace se správcem daně, přes práci s důkazy až po včasné uplatnění procesních práv.
Podívejte se na naše další články ze světa daní, daňového poradenství a financí. Najdete nás na EKP Advisory, Facebook či LinkedIn.
EKP je členem Prime Global, jedné z TOP 5 mezinárodních organizací sdružujících nezávislé poradenské a účetní firmy po celém světě.